Peptide Library

本文章由GeneDireX技術支援提供

生產多樣辨識目標抗體、抗原決定位圖譜定位(epitope mapping)及胜肽與目標蛋白與其它物質親和性實驗，需篩選出特定序列等實驗時會需要建立peptide library，目的是找到有效最短區域，library是如何尋找最短區域的一些方法及規則。

1. Overlapping peptide library：原始有效序列分成許多序列且有重疊的等長片段，最佳長度為8~20 個胺基酸，重複片段至少6個胺基酸

圖、Overlapping peptide library

2. Alanine scanning library：原始序列中，用Ala個別置換不同位置，連帶影響epitope的活性，鑑定單一胺基酸對整條序列活性的影響，會用Ala是因為它是最小的掌性胺基酸，因此最常用來取代其他胺基酸位置，然而其他胺基酸也可以這樣使用，但是需要經過評估。

圖、Alanine scanning library

3. Truncation library：找出最有效且片段最短的序列，從N端或C端序列開始一個一個減少，製造出許多短片段，而在Alanine scanning library之後會知道關鍵胺基酸是哪一個，再藉由truncation的方式scanning關鍵胺基酸附近的序列。

圖、Truncation library

4. Positional scanning library：同一位點用其他不同胺基酸取代，決定序列中有活性且有作用的區域及位點。

圖、Positional scanning library

5. Random library：胺基酸序列中某一個或某數個特定位置，被由20種胺基酸機率均等的方式所取代，這些排列組合即產生許多具有可能增加及降低活性的peptide 序列，適合用來找出具有高度活性序列的實驗

圖、Random library

6. Scrambled library：已知的有效序列，做胺基酸位置的排列組合，序列變化性是最高的，通常是用來當作negative control證明原始排列組合的序列具有功能及活性

圖、Scrambled library

回到胜肽合成介紹主頁